Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ptprn2P80560 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ptprn2P80560 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ptprn2P80560 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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