Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rab1AP62821 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms