Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SnrpfP62307 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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