Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcmtd1P59913 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.2 ms