Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Dpf3P58269 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dpf3P58269 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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