Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gsc2P56916 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms