Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf5P56477 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf5P56477 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms