Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
GferP56213 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
GferP56213 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
GferP56213 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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