Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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TspoP50637 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TspoP50637 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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TspoP50637 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
TspoP50637 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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