Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmod1P49813 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms