Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gbx2P48031 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gbx2P48031 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms