Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ItgavP43406 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ItgavP43406 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms