Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cox6a1P43024 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cox6a1P43024 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms