Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chd1P40201 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms