Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptger1P35375 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptger1P35375 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Ptger1P35375 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ptger1P35375 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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