Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms