Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp4P35123 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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