Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Apoc1P34928 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms