Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
RxraP28700 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
RxraP28700 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms