Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd10P28359 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd10P28359 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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