Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Defa2P28309 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms