Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms