Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PrkchP23298 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkchP23298 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms