Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eif3aP23116 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eif3aP23116 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms