Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd3eP22646 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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