Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb9P20615 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms