Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Fcer1aP20489 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Fcer1aP20489 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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