Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pou5f1P20263 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms