Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P20040 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P20040 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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P20040 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P20040 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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