Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18533 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18533 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P18533 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18533 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.4 ms