Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Irf1P15314 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Irf1P15314 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Irf1P15314 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Irf1P15314 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Irf1P15314 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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