Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb1P13372 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms