Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P10404 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P10404 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P10404 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P10404 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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