Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P06323 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06323 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06323 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06323 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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P06323 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P06323 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06323 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P06323 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P06323 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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