Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-Eb1P04230 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms