Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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