Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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CcnkO88874 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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CcnkO88874 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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CcnkO88874 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms