Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BlmO88700 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BlmO88700 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BlmO88700 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BlmO88700 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BlmO88700 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms