Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rdh16O54909 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms