Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CrxO54751 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CrxO54751 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms