Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prrt1O35449 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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