Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq1O09165 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms