Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Sec22bO08547 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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