Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Efna3O08545 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Efna3O08545 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Efna3O08545 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms