Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2056J3QQ02 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2056J3QQ02 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms