Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8356J3QPD3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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