Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Top6blJ3QMY9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Top6blJ3QMY9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Top6blJ3QMY9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top6blJ3QMY9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top6blJ3QMY9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Top6blJ3QMY9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Top6blJ3QMY9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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