Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3415J3QMS8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms