Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21060J3KMU4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms