Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r34G3XA52 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms